آیة الله شیخ محمد رضامظفردرشانزدهم ماه مبارک رمضان سال 1383ه ق ، در سن 62 سالگى دار فانی را وداع گفت .
آن عالم ربانی درپنجم شعبان سال 1322هجرى قمری دیده به جهان گشود. و ی پس ازفراگیری تحصیلات مقدماتی به آموختن ادبیات عرب پرداخت وپس ازطی دوره سطح فقه و اصول به حضور درجلسات حکمت و فلسفه وعرفان روی آورد . دراین دوره میرزا محمد حسین نایینى ، شیخ آقا ضیاء الدین عراقى و میرزا عبدالهادى شیرازى ازجمله استادان اوبودند . آن عالم ربانی پس ازچندی به درجه اجتهاد نایل آمد . وی همچنین بعدها علاوه برعلوم دینى به فراگیرى دانشهایى چون حساب ، هندسه ، جبر، هیئت و عروض پرداخت . شیخ محمد رضا مظفردرکنار تحصیل ، مطالعه وتحقیق ، به تدریس معارف حوزه علمیه مشغول بود. وی در طول عمر خویش باقیات صالحاتی به جای نهاد که از میان آنها می توان به تشکیل جمعیت دینی - آموزشی منتدى النشر ، دانشکده منتدى ، مدارس منتدى ، دانشکده فقه و تالیف کتب آموزش حوزه ها اشاره کرد . در دانشکده فقه وی در نجف اشرف ، دروسی چون فقه امامیه ، فقه تطبیقى ، اصول فقه ، تفسیر و اصول و مبانى تفسیر، حدیث و اصول حدیث ، روان شناسى ، ادبیات و تاریخ ادبیات ، جامعه شناسى ، تاریخ اسلام ، فلفسه اسلامى ، فلسفه جدید، منطق ، تاریخ جدید، اصول تدریس ، نحو، صرف و یک زبان بیگانه تدریس می شد .
آن عالم ربانی همچنین به تربیت شاگردان بسیارهمت گمارد که شیخ احمد قبیسى ، شیخ احمد وائلى ، سید جواد شبر، شیخ جواد قسام ، شیخ صالح آل شیخ راضى ، سید عبدالکریم قزوینی و ... از جمله آنها هستند .از آن عالم فرزانه آثارگرانسنگی نیزبه جا مانده است که ازمیان آنها می توان به اصول الفقه ، عقاید الامامیه ، المنطق ، احلام الیقظه ، تاریخ الاسلام ، تتمه احکام الیقظه ، حاشیة المکاسب ، حریة الانسان وارتباطها بقضاءالله ، دیوان شعر، رسالة عملیة فى ضوء المنهج الحدیث ، الزعیم الموهوب السید ابوالحسن اصفهانى ، السقیفة ، شرح حال صدرالدین شیرازى ، شرح حال شیخ محمد حسن نجفى (صاحب جواهر)، شرح حال شیخ حسین اصفهانى ، شرح حال مولا محمد مهدى نراقى ، شیخ الطوسى مؤ سس جامعة النجف ، على هامش السقیفة ، فلسفة ابن سینا، الفلسفة الاسلامیة ، فلسفه الامام على علیه السلام ، فلسفه الکندى ، المثل الافلاطونیة عند ابن سینا، مجموعه اشعار، مجموعه اى از رسائل در علم کلام ، مذاکرات الشیخ ، النجف بعد نصف قرن اشاره کرد . آیة الله شیخ محمد رضامظفر سرانجام در شانزدهم ماه مبارک رمضان سال 1383، در سن 62 سالگى به دیار ابدی شتافت . پیکر مطهرش در جاده کوفه ، در کنار مرقد برادرش شیخ محمد حسن مظفر به خاک سپرده شد.
